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Simple sequence repeat (SSR)
>UN82886
TAGAGAGCTTCCTTTTTTTCTTCTATGCGATCAGATTTTCTCAGAGGTAAACCAAAAAAAAAAAAGCTTTTCTCTTTGCGTCTTTGATTACTTA
AAAAACAATCCGAGAATAACGATGAAGTTATAAACTTGGTGTGTTCCTTTGCATAGTTCGTTGCCTTTGTCCGTACACACGTTGTTTGTTTAAT
CGGTTTCTCAAGTTGTTTTGTTTAATAAACTGACTTGTTGATCCGGAAACGAGTTAACAAAAAAGAGTTAGTTTCCGATGTTGCAAAAAATGGT
TAATTATGGATCTGTTAGTGTTAATTTTTGGGTTAAAAAGTTTGTTTATTTTGTATCTCTCTCTCTCTCTCTTATTAACTAACAAACTCCTTTC
CTTCTCTCCTGTCTGCTTATAGTTTCTGCAGTTATGAACTTTCTGTTTTTTCTTTCATGTATATGCTTATGTATACCTTCATTCACAAGCAAAG
ATTCATCCGGGATCTCAATAAGTTTCTTCAATTTTTCTTTTTTTTTGCAGTGAGATCGATCGAGCGGGAAAGATTATTATTTATATTGCCATGG
GAGATGATGAGCAGTCTCACCTCAAATTCACCCTTCTGCTCGAATCAGCAGCCTCCAATGATCTCTCCGGCTTCAAGTCACTAATCGAAGAAGA
GGGTCTCGATACCGTTGATCGGTCTGGTTTGTGGTACGGGAGGAGGTTAGGAACAACGAAGATGGGTTTCGAAGAGAGAACTCCTCTTATGATT
GCCGCCCTTTTCGGAAGC |
Primers for UN82886 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
GACTTGTTGATCCGGAAACG |
60.495 |
20 |
CCGGATGAATCTTTGCTTGT |
60.074 |
20 |
261 |
220 |
480 |
| 2 |
TTGTTGATCCGGAAACGAGT |
60.495 |
20 |
CCGGATGAATCTTTGCTTGT |
60.074 |
20 |
258 |
223 |
480 |
| 3 |
ACTTGTTGATCCGGAAACGA |
60.495 |
20 |
CCGGATGAATCTTTGCTTGT |
60.074 |
20 |
260 |
221 |
480 |
|
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