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Simple sequence repeat (SSR)
>UN29001
AAGCACATCCAGACTCCACTTTGATCTCAAACGCTTATACATAATAATATTACAAAAGTATCTGTAAATGGATAATAATGATAATAATGTGATC
ATGACATTCACGTCAGCTTCATCTCACACTCACACCGAATCTGCACTCTGCGATACTTTAGGCCCCGTGTTAACCACCACTTTCCCATCCGGTC
CGGTCATGCCACTAACCGGCTGACCCATTCCCTGGTACTGAGGCTGATGCGGTTGCGGCGGCACCATCATACCATCCCCAGCCACAGTATAGTA
CACAGGATTCCCCATCTGTGAATACGGCGGCGTTTCGTGTAATCCCATTGGACCACTACTCATAACCTGTGGACCACCTGAATACGTTGGCTGT
TGTGGTGGTTGAACCACGTTGTAACCACCTCGCTGGTTCTGCTGCTCCATGTAAGGATCAGGATGATGCTGTTGGATACGTTGAACAGGTGGGT
AATACCCTTGGCTTCCTTGTGTCGGTGGTGGTGGTCTCATCACGCTGTGGTATAACGTCCCTGGTGCTTGAGACTGAGCTGGGATCATGTATAC
TTGCTGCTGCTCCGTCGTTGTGTAAATGTTGTTCCCCGGAACGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCTTGATCTCTAATTTGAATCCTCTGAAACTC
ATGGATCTGTCGTTGAATCTCCTGCTCCGGTGTTATCACCTGTTGGTTAAGGAACATCTGCGGATCCTGAATCTGTTGTTGATTCGTCTGAGAC
ACCGTCGTCGTCGTCGGTGGCGGCTGCTGCTGAGGAGGATTTTGAGCGTAGGTTGGAGTGAAGTAACGTCCGTCTTGGCTGTTTCTTCTGTACA
TAGCCTCTTGCTGTTGAAGCTGCTGTATCTGTTGATGTTGTTGCTGTTGTTCTTGATCTCTAATTTGAATCCTCTGAAACTCATGGATCTGTCG
TTGAATCTCCTGCTCCGGTGTTATCACCTGTTGGTTAAGGAACATCTGCGGATCCTGAATCTGTTGAGCCACCGTCACTGCCGCCGGCGGAGAC
GGCGGAGCTACGACTACTTTCTCCGATCCGAACAAGAAATCGGCGTTACTCGCCGGAGCGGTTAC |
Primers for UN29001 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') |
Reverse primer (5'-3') | Product |
|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature |
Size | Size | Start | End |
|---|
| 1 |
CGCTGTGGTATAACGTCCCT |
60.015 |
20 |
ACAGGTGATAACACCGGAGC |
59.997 |
20 |
189 |
513 |
701 |
| 2 |
CGCTGTGGTATAACGTCCCT |
60.015 |
20 |
GGATCCGCAGATGTTCCTTA |
60.036 |
20 |
213 |
513 |
725 |
| 3 |
CGCTGTGGTATAACGTCCCT |
60.015 |
20 |
GATTCAGGATCCGCAGATGT |
60.042 |
20 |
219 |
513 |
731 |
|
|
